Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.3 ms