Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC8Q8TC99 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms