Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CLDN19Q8N6F1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CLDN19Q8N6F1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CLDN19Q8N6F1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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CLDN19Q8N6F1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CLDN19Q8N6F1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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