Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J2

C16orf62, UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62Q7Z3J2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C16orf62Q7Z3J2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms