Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms