Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q7L0L9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q7L0L9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q7L0L9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q7L0L9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q7L0L9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q7L0L9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q7L0L9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q7L0L9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q7L0L9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q7L0L9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q7L0L9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q7L0L9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q7L0L9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q7L0L9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q7L0L9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q7L0L9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms