Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A4Q6P1M0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms