Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms