Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms