Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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CCDC96Q2M329 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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CCDC96Q2M329 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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CCDC96Q2M329 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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CCDC96Q2M329 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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CCDC96Q2M329 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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CCDC96Q2M329 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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CCDC96Q2M329 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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CCDC96Q2M329 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
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CCDC96Q2M329 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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CCDC96Q2M329 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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