Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms