Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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