Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms