Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK5R1Q15078 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK5R1Q15078 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK5R1Q15078 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK5R1Q15078 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK5R1Q15078 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDK5R1Q15078 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK5R1Q15078 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK5R1Q15078 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDK5R1Q15078 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK5R1Q15078 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK5R1Q15078 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDK5R1Q15078 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDK5R1Q15078 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK5R1Q15078 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDK5R1Q15078 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDK5R1Q15078 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDK5R1Q15078 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDK5R1Q15078 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDK5R1Q15078 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CDK5R1Q15078 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CDK5R1Q15078 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CDK5R1Q15078 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK5R1Q15078 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK5R1Q15078 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK5R1Q15078 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK5R1Q15078 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK5R1Q15078 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CDK5R1Q15078 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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