Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IKBKEQ14164 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms