Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
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