Protein–RNA interactions for Protein: Q14019

COTL1, Coactosin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COTL1Q14019 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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COTL1Q14019 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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COTL1Q14019 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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COTL1Q14019 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COTL1Q14019 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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COTL1Q14019 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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COTL1Q14019 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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