Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms