Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSTF3Q12996 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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