Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NFIAQ12857 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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