Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms