Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms