Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TFAMQ00059 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms