Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms