Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms