Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLE2P56282 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLE2P56282 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLE2P56282 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms