Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO3P55854 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms