Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERFP50548 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERFP50548 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERFP50548 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms