Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms