Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LTBRP36941 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LTBRP36941 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LTBRP36941 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LTBRP36941 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LTBRP36941 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LTBRP36941 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LTBRP36941 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBRP36941 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBRP36941 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBRP36941 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBRP36941 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBRP36941 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBRP36941 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBRP36941 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms