Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms