Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms