Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA4P25789 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms