Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB1P16220 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CREB1P16220 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CREB1P16220 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CREB1P16220 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms