Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms