Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC172P0C7W6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC172P0C7W6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms