Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX4O95219 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX4O95219 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX4O95219 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX4O95219 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX4O95219 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms