Protein–RNA interactions for Protein: O43559

FRS3, Fibroblast growth factor receptor substrate 3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRS3O43559 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRS3O43559 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRS3O43559 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRS3O43559 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms