Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MUSKO15146 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MUSKO15146 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MUSKO15146 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MUSKO15146 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MUSKO15146 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MUSKO15146 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MUSKO15146 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MUSKO15146 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms