Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APAF1O14727 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APAF1O14727 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APAF1O14727 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms