Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
E9PBE3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
E9PBE3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
E9PBE3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E9PBE3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E9PBE3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E9PBE3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms