Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms