Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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SNX13Q9Y5W8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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SNX13Q9Y5W8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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SNX13Q9Y5W8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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SNX13Q9Y5W8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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SNX13Q9Y5W8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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SNX13Q9Y5W8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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SNX13Q9Y5W8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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SNX13Q9Y5W8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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SNX13Q9Y5W8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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