Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TPRKBQ9Y3C4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms