Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
YBX2Q9Y2T7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
YBX2Q9Y2T7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms