Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms