Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms