Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCG2Q9UNQ0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms