Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPHA6Q9UF33 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPHA6Q9UF33 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms