Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2AFY2Q9P0M6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms